北碚美国纽勤木糖发酵管新鲜样可暂时保存于冰箱或冰柜中，但须在10天内进行提取处理。从野外采回的土壤样品要及时放在样品盘上，摊成薄薄的一层，置于干净整洁的室内通风处自然风干，严禁曝晒，并注意防止酸、碱等气体及灰尘的污染。木糖发酵管批发风干过程中要经常翻动土样并将大块捏碎以加速干燥，同时剔除土壤以外的侵入体，细小已断的植物须根，可用静电吸附的方法清除。
北碚美国纽勤木糖发酵管滤水管的长度取决于地下水位的深度，每个孔内，滤水管从井底一直延伸到高于静态水位以上约10 cm。监测井滤管周围用大于0.25 mm的干净石英砂回填作为滤水层，并填至滤管以上20 cm。填砂过程中缓慢地将不锈钢套管拔出以防管壁坍塌。木糖发酵管批发石英砂与地面以下的空间不填入任何东西。在采集完水样后，所有的PVC井管都被拔出，然后井孔用原土回填。
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北碚美国纽勤木糖发酵管制备好的样品要妥善储存，避免日晒、高温、潮湿和酸碱等气体的污染。在全部分析工作结束，分析数据核实无误后，试样一般还要保存3个月至半年，以备查询。少数有价值需要长期保存的样品，木糖发酵管批发须保存于广口瓶中，用蜡封好瓶口。有条件的地方，样品应低温保存。指示菌"一词可用于任一群在分类学.生理学或生态学上相似的微生物.它们的存在与否可指示样品在过去或现在所具有的而不能直接证明的某些特征。
