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南川法国梅里埃培养基新鲜样可暂时保存于冰箱或冰柜中，但须在10天内进行提取处理。从野外采回的土壤样品要及时放在样品盘上，摊成薄薄的一层，置于干净整洁的室内通风处自然风干，严禁曝晒，并注意防止酸、碱等气体及灰尘的污染。培养基订购风干过程中要经常翻动土样并将大块捏碎以加速干燥，同时剔除土壤以外的侵入体，细小已断的植物须根，可用静电吸附的方法清除。

南川法国梅里埃培养基制备好的样品要妥善储存，避免日晒、高温、潮湿和酸碱等气体的污染。在全部分析工作结束，分析数据核实无误后，试样一般还要保存3个月至半年，以备查询。少数有价值需要长期保存的样品，培养基订购须保存于广口瓶中，用蜡封好瓶口。有条件的地方，样品应低温保存。指示菌"一词可用于任一群在分类学.生理学或生态学上相似的微生物.它们的存在与否可指示样品在过去或现在所具有的而不能直接证明的某些特征。

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南川法国梅里埃培养基滤水管的长度取决于地下水位的深度，每个孔内，滤水管从井底一直延伸到高于静态水位以上约10 cm。监测井滤管周围用大于0.25 mm的干净石英砂回填作为滤水层，并填至滤管以上20 cm。填砂过程中缓慢地将不锈钢套管拔出以防管壁坍塌。培养基订购石英砂与地面以下的空间不填入任何东西。在采集完水样后，所有的PVC井管都被拔出，然后井孔用原土回填。

南川法国梅里埃培养基对于水果的保存，郭晓成说，应根据种类的不同而区别对待：桃子、苹果、葡萄应保持干燥、裹保鲜膜，入冰箱冷藏室保鲜；西瓜应裹保鲜膜入冰箱保存，保鲜膜连皮包裹；荔枝应用盐水浸泡，沥干入保鲜袋，放冰箱冷冻层，培养基订购食用时先自然解冻；香蕉、木瓜、芒果等热带水果应用报纸包裹放在阴凉通风处，切忌放入冰箱，易冻伤。